O Ministério Público Federal está investigando saques na conta específica do antigo FUNDEF do Município de Geminiano sem a correspondente comprovação de despesa. O procurador da República Francisco Alexandre de Paiva Forte instaurou inquérito civil público através da portaria n° 01, de 31 de janeiro de 2013, para investigar se houve ou não irregularidade passível de sanção por improbidade. 

O procurador mandou expedir ofício solicitando extrato detalhado ou relatório que especifique os meses e valores sacados da conta do antigo FUNDEF, “uma vez que a nota técnica 2349/2011 da CGU não contém elementos detalhados, limitando- se a mencionar a irregularidade no município de Geminiano” e determinou ainda a expedição de ofício ao Tribunal de Contas do Estado do Piauí, solicitando informações sobre o julgamento das contas do antigo FUNDEF do Município de Geminiano nos exercícios de 1998 a 2005, “especificando os eventuais responsáveis em caso de irregularidades constatadas especificamente no que concerne a saques na conta específica do FUNDEF do Município de Geminiano”.